8月18日，吉祥航空发布上半年财报，受疫情影响航班量大幅缩减，吉祥航空实现营业收入41.69亿元，同比下降48.28%；归属于上市公司股东的净亏损为6.75亿元，而去年上半年为盈利5.79亿元，同比下降216.71%。
上半年吉祥航空旅客运输总量超过532万人次，同比下降50.88%，航班平均客座率下降17.45个百分比。其中吉祥航空在上海两场旅客运输量达到251.36万人次，在上海的市场占有率达到10.9%；在南京机场旅客运输量达到64.66万人次。
截至6月底，吉祥航空拥有66架空客A320系列飞机、6架波音787系列飞机，全机队客座率为67.93%，飞机日利用率为6.27小时，远低于正常年份水平。其中A320系列日利用率为6.33小时，787分机日利用率为5.11小时。
上半年吉祥航空运营着超过220条以上海为主运营基地始发国内、国际、港澳台地区航线，主要航线目的地均为省会城市、经济发达城市以及旅游城市。
上半年，吉祥航空子公司九元航空实现营收7.37亿元，净亏损1.65亿元；旅客运输总量达132.89万人次。吉祥航空运营20架波音737系列飞机（其中737max一架，目前处于停飞状态），737飞机日利用率为6.4小时。
为了改善经营状况，减少疫情带来的损失，吉祥航空积极扩展市场机遇，灵活开展“客改货”业务，制定一系列临时国际货运包机风险管控程序，完成26条货运包机航线的风险评估，保障了20个国家23个机场新增的航班加油需求。3月29日，祥航空派出787执行上海直飞西班牙的首次洲际包机，成为全民航第一家获得客舱内载货运行资质的航司。为寻求货运收入最大化，公司总结经验，增加窄体机作为执飞亚洲地区的货运包机。截至6月30日，祥航空货运包机共执飞近200班，货邮总量达3000吨，上半年货运毛利润同比增长472.53%。