2016年，机场集团年旅客吞吐量突破5896.79万人次，同比增长12.6%，运输起降架次46.69万架次，同比增长8.8%,货邮吞吐量41.9万吨，同比增长8.4%，三大运输生产指标再创历史新高，机场集团圆满实现第12个安全年。
2016年长水机场航班放行正常率平均达89.8%，稳居全国千万级机场前三，西双版纳、丽江机场航班正常率稳步提升，继续排名全国前列。航线网络方面，新开昆明-旧金山、悉尼两条洲际定期航线，昆明-阿斯旺、开罗两条非洲包机航线，昆明机场开通洲际航线达到4条，国际和地区航线达到67条，集团航线总数达到408条。
2016年旅客吞吐量
昆明机场 4198万人次
大理、芒市机场 破100万人次
普洱思茅机场 首破40万人次
腾冲机场 首达80万人次
丽江机场 678万人次