吉祥航空公布2020年12月吉祥航空和九元航空合并数据，2020年12月，客运运力投入（按可用座位公里计）同比下降6.47%，其中国内、国际和地区航线客运运力投入同比变动分别为13.89%、-89.42%和-79.16%；旅客周转量（按收入客公里计）同比下降9.29%，其中国内、国际和地区航线旅客周转量同比变动分别为7.98%、-92.94%和-95.21%；客座率为78.43%，同比下降2.44%，其中国内、国际和地区航线客座率同比变动分别为-4.33%、-23.10%和-59.19%。
2020年12月，吉祥航空国内客运运力投入（按可用座位公里计）较上月环比上升5.29%，国内旅客运输量（按收入客公里计）环比上升4.39%，国内航线客座率环比下降0.68%。
2020年12月，吉祥航空新增以下定期航线：新增无锡—青岛—长白山往返航线（每周7班）。截至2020年12月31日，吉祥航空运营72架A320系列飞机（其中27架为A321机型、8架为A320neo机型、1架为A321neo机型），6架波音787系列飞机。子公司九元航空实际运营20架飞机，均为波音737系列飞机。
据公告，2020年，吉祥航空共运载乘客1571.69万人次，同比减少28.62%；客座率为75.19%，同比减少10.04个百分点。