2月10日，菲律宾卫生部(DOH)发表声明称，为防止冠状病毒的传播，对中国大陆及其特别行政区实施了临时旅行禁令，台湾也在禁令范围之内。
菲律宾政府于周一晚间发布了菲律宾和台湾之间航班的新旅行限制，导致航班服务暂停，从2月11日起生效。菲律宾民航委员会（CAB）禁令写道，基于一个中国政策，台湾包括在菲律宾对中国大陆、香港、澳门实施的“临时旅行禁令”内，除了菲律宾公民及持有永久居留签证者，其他旅客无论国籍，若在14天内到过中国大陆、香港、澳门或台湾，将暂时禁止入境菲律宾。
菲律宾航司已经暂停往来台湾航班服务，而部分台湾航司截至周二上午仍在运营服务。
因应菲律宾政府最新入境规定，亚航宣布，自即日（2/11）起，菲律宾-台湾之间航班全部取消，深夜飞宿雾Z27149班机、长滩岛Z225班机，因台湾旅客抵达当地后无法入境，因此所有旅客将在今天中午搭原机返抵桃园机场。亚航贴出公告表示，复航时间将会另行公告。因应之改票退票方式，确认后也会尽快另行公告。
菲律宾民航委员会昨晚下令，但数架班机在命令发布前起飞，约150名台湾旅客抵达宿雾、卡利波、马尼拉等机场后被拒绝入境。据称，106名滞留卡利波机场的旅客将原机返台；滞留马尼拉机场旅客则可能搭乘上午10时45分的中华航空班机返台。