随着昌吉赣（南昌—赣州）、商合杭、京霸铁路环评陆续进入公示，整个京九高铁走向基本确定。
根据10月7日铁三院公布的京霸铁路环评公示线路图显示，该线路经过北京新机场、霸州、衡水、聊城（山东）。
而商合杭高铁环评显示图也标明，上述铁路从聊城继续向南，到达菏泽，再到阜阳、麻城、九江、南昌、吉安，再往南到赣州、龙川、深圳。其中商丘到阜阳段，属于商合杭（商丘—合肥—杭州高铁）客运专线的北段。
不过21世纪经济报道获悉，阜阳到麻城、九江段的高铁，在“十三五”期间建设的可能性比较小，原因是目前暂时未纳入国家“十三五”铁路规划。而阜阳—合肥—安庆—九江高铁进展更快，这一段部分已经动工，有的已经在环评公示。而阜阳—麻城—九江段目前预可研报告都还没出来。
这意味着“京九高铁‘十三五’期间走安徽安庆、合肥，不走湖北麻城”。一位知情人士谈起该线路走向时说。
全线设计时速350公里/小时
京九高铁，又名京九客运专线，是国家中长期铁路网规划中的规划研究项目之一，实际上采用各地分段建设最后连成一线的方式建设。根据2008年国家铁路调整方案，京九高铁从北起首都北京，南至香港九龙，跨越京、冀、鲁、豫、皖、鄂、赣、粤、港等地。而随着各省提出多条铁路新线，使得京九高铁走向有复杂的选择。
而据昌吉赣（南昌—赣州）、商合杭、京霸铁路的环评公示，整个京九高铁走向基本确定。
根据上述环评公示，该线路一个大变化是，作为国家干线，整个京九高铁将采用时速350公里的设计，原先确定的很多250公里的城际铁路都要上调。
比如目前京霸铁路时速确定为每小时350公里。昌吉赣客运专线原先定为每小时250公里，目前则上调到时速350公里。而商丘到阜阳（商合杭的北段）时速350公里的高铁已经开工。
南昌到九江目前已经有一条时速250公里的高铁。但是据21世纪经济报道记者了解，两地将重修一条时速350公里的铁路。
江西九江发改委调研员丁杰在近期的一次访谈中也指出，江西目前请求列入国家和省“十三五”规划的高速铁路有昌九高铁，其走向在九江境内基本与现有昌九城际铁路平行或并线，在南昌境内另行选线，接入南昌西站。
21世纪经济报道获悉，目前江西的昌吉赣客专已经动工，而赣深客运专线已经纳入到了国家“十三五”规划。这两条属于与江西有关的京九高铁部分段。
铁路资深规划专家张江宇认为，整个京九高铁“十三五”大部分动工是肯定的，比如京霸铁路，以及霸州往南到山东、河南段、江西段、广西段等。
“十三五”或先走合肥
不过，21世纪经济报道获悉，京九高铁短期可能不会走湖北麻城，而是走东边的合肥、安庆。
一位知情人士指出，铁道部门初期勘察发现，走西线（麻城）地质条件复杂，而后来安徽加快了铁路推进的进度，这使得商丘到合肥、九江的建设步伐加快。
这为京九铁路走东线（经过合肥）创造了条件，而西线推进很慢。这样导致的结果是，“东线可能先完工，从北京到深圳的高速客车会走合肥，而不是走麻城。除非在五六年客流饱和后，再修西线（走麻城）。”
根据了解，目前安庆到合肥的客运专线正在铁四院环评公示，也是以时速350公里设计的，其线路图显示，从合肥到安庆，再到湖北黄梅、九江，都有连接。考虑到商合杭（商丘—阜阳—合肥—杭州）也是时速设计350公里，因此整个京九高铁初期将从北京到商丘后，通过合肥再到九江、南昌进而南下到深圳，而不走麻城，似乎成了定局。
但是这并不意味着湖北麻城就没有机会。
张江宇认为，湖北可以先修从九江到麻城，再到阜阳的城际铁路，未来再通过升级，变成时速350公里的铁路。这有点类似武汉到十堰的城际铁路，最后还是变成了国家干线。
中国区域经济研究会副会长、 安徽省徽商发展研究院院长程必定认为，初期京九高铁从合肥、安庆等地方走，不走麻城，有利于合肥地区的发展，“缩短了以往合肥到周边地方的时空距离，也增加了合肥的区域地位和经济交流的频率”。
湖北社科院副院长秦尊文指出，京九高铁经过大别山区的麻城，是多个规划定好的，现在需要加快项目对接进度，以免耽误大别山地区的发展。